十一卷，卷一總論，總述諸品藥性陰陽論、用藥陰陽法象、手足三陰三陽明訓圖、藥性升降浮沉補瀉法、引諸經報使歌訣、瀉諸經火邪用藥例、散諸經寒邪用藥例、洽諸經頭痛要藥、孕婦忌用諸藥、藥有十八反、藥有十九畏、藥性賦等。卷二至卷十各論，共收錄藥物706味，分為草木花卉部、金石貝壤部、人部、蟲豸禽獸部分述各藥。卷十一附太醫院經驗捷效單方156首。本次整理以日本龍谷大學圖書館收藏的明代嘉靖二十四年（1545）明德堂刻本為底本。

新刊藥性要略大全卷之一諸品藥性陰陽論用藥陰陽法象古人服藥有法手足三陰三陽明訓圖手足陰陽表里引經主治例藥性升降浮沉補瀉法東垣引經引諸經報使歌訣瀉諸經火邪用藥例散諸經寒邪用藥例治諸經頭痛要藥隨症用藥凡例攻克血積癥瘕諸藥攻克諸積藥例孕婦忌用諸藥藥有十八反藥有十九畏藥性賦寒熱溫平四章新刊藥性要略大全卷之二草木花卉部人參黃芪甘草山藥白扁豆芡實茯苓茯神白術蒼術沙參玄參苦參貝母知母黃柏黃連胡黃連黃芩黃梔丹參紫參天門冬麥門冬生地黃熟地黃當歸川芎撫芎芎勞白芷藁本細辛杜蘅白芍藥赤芍藥桔梗烏藥新刊藥性要略大全卷之三厚朴陳皮青皮枳殼枳實半夏南星蒟蒻前胡柴胡銀柴胡葛根升麻麻黃桂筒桂肉桂桂心桂花紫蘇蘇子玄胡索葫蘆巴補骨脂骨碎補狗脊菟絲子胡麻子大麻子苘麻子白油麻覆盆子金櫻子肉蓯蓉鎖陽牛膝杜仲訶子黑附子側子天雄川烏白附子白薇白蘞白及續斷石斛遠志益智縮砂仁白豆蔻草豆蔻草果肉果香附子新刊藥性要略大全卷之四紅豆良姜生姜干姜川椒秦椒胡椒蓽撥蓽澄茄吳茱萸山茱萸蔥白蔥子大蒜韭子胡荽蘿卜山楂使君子木瓜甜瓜蒂王瓜王瓜根王瓜子瓜蔞子天花粉地骨皮枸杞子五味子鶯粟鶯粟殼薏苡仁何首烏石蓮子蓮子蓮花、蓮須蓮葉、蓮房藕藕節汁蒲黃菖蒲艾葉薄荷荊芥穗香薷神曲麥芽大麥小麥浮小麥蕎麥粳米陳米粟米黍米糯米谷芽飴糖酒醋淡豆豉赤小豆綠豆粉黑大豆山豆根威靈仙防風連翹羌活獨活天麻定風草赤箭萆薜菝葜山牛桑寄生楓寄生淫羊藿大楓子牛蒡子蒼耳子蒼耳草佛耳草新刊藥性要略大全卷之五益母草茺蔚子蔓荊子決明子蓖麻子白蒺藜木賊草密蒙花旋覆花甘菊花菊花白菊花款冬花金銀花過冬藤釣藤青藤尋風藤甘露藤石楠葉茵芋葉芙蓉葉尤美葉海桐皮榆皮秦皮白鮮皮白楊皮紫荊皮牡荊子紫荊木牡丹皮五加皮桑白皮桑汁杏仁桃仁桃梟桃膠郁李仁柏子仁紅花蘇木干漆京三棱草三棱蓬莪術阿魏郁金姜黃蓮藥大黃巴豆皂莢雷丸大腹子大腹皮檳榔牽牛商陸秦艽防己木通通草燈心草豬苓澤瀉瞿麥篇蓄車前子茵陳昆布海藻甘遂芫花蕘花大戟巴戟……新刊藥性要略大全卷之六新刊藥性要略大全卷之七新刊藥性要略大全卷之八新刊藥性要略大全卷之九新刊藥性要略大全卷之十太醫院經驗捷效單方卷之十一校注后記